基本信息
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职业迁徙
个人简介
研究方向
生物信息学:人单体型基因组组装,细菌系统生物学,肿瘤系统生物学,机器学习,生物学特征统计建模及模式识别,高通量数据分析流程及软件开发
科研项目
1.主持项目
1. 深圳大学新引进教师科研启动基金:肿瘤预后和药物治疗反应预测软件群的开发,2015.6-2017.5, 6万。
2. 国家自然科学基金青年项目,“八个新鉴定的沙门氏菌III型效应蛋白的功能研究”(NSFC81301390),2014.1-2016.12, 23万。
3. 加拿大萨斯喀彻温省医疗卫生科研基金(SHRF)博士后基金,Connecting salmonella persistence and virulence: examining the role of CsgD in regulating type III secretion,2013.9-2014.12, CAD 100,000。
2.参与项目
1. 国家自然科学基金:“基于循环外泌体的食管鳞癌早期诊断非编码RNA分子标记物的筛选、验证及机制研究”(NSFC 81572908),2016.1-2018.12,主要参与人。
代表性成果
开发生物学软件十余个,数据库5个;国际专利2项;论文总被引>500次。
代表性论文(*表示通讯作者)
1. Wang Y, MacKenzie KD, White AP. (2015). An empirical strategy to detect bacterial transcript structure from directional RNA-seq transcriptome data. BMC Genomics. 16:359.
2. Wang Y1*, Wei X1, Bao H, Liu SL*. (2014). Prediction of bacterial type IV secreted effectors by C-terminal features. BMC Genomics. 15:50. *Co-corresponding authors;1Co-first authors.
3. Wang Y, Sun M, Bao H, Zhang Q, Guo D. (2013). Effective identification of bacterial type III secretion signals using joint element features. PLoS ONE, 8(4):e59754.
4. Wang Y, Huang H, Sun M, Zhang Q, Guo D. (2012). T3DB: an integrated database for bacterial type III secretion system. BMC Bioinformatics, 13:66. (A highly accessed paper)
5. Wang Y, Zhang Q, Sun M, Guo D. (2011). High-accuracy prediction of bacterial type III secreted (T3S) effectors based on position-specific amino acid composition profiles. Bioinformatics, 27(6):777-784.
6. Wang YJ, Hou Y, Huang H, Liu GR, White AP and Liu SL. (2008). Two oral HBx vaccines delivered by live attenuated Salmonella: both eliciting effective anti-tumor immunity. Cancer Letters, 263(1):67-76.
社会兼职
国家自然科学基金委、深圳市科创委评审专家;Bioinformatics、BMC Bioinformatics、BMC Genomics、Journal of Bacteriology、Applied and Environmental Microbiology、PLoS ONE、Int. J. Data Mining and Bioinformatics等期刊审稿人。
研究兴趣
论文共 60 篇作者统计合作学者相似作者
按年份排序按引用量排序主题筛选期刊级别筛选合作者筛选合作机构筛选
时间
引用量
主题
期刊级别
合作者
合作机构
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) (2023)
引用0浏览0引用
0
0
TRENDS IN MICROBIOLOGYno. 11 (2023): 1162-1178
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) (2023)
Chuanliang Xu,Lü Zhou,Qiongfang Fang,Yinglin Liu,Jielin Yang, Lijun Luo, Sichun Li, Ping Guo, Y. Niu, Wenxin Deng,Xueqing Wu,Yueming Hu,
Research Square (Research Square) (2023)
引用1浏览0引用
1
0
Computational and Structural Biotechnology Journal (2023): 4580-4588
引用0浏览0WOS引用
0
0
Lingyu Qiu, Chen Liang, Yidong Zheng,Huayu Kang,Aiyue Chen, Chunlin Chen,Xinlong Wang,Jielin Yang,Qiongfang Fang,Xinjie Hui,Yueming Hu,Zewei Chen,
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