主要从事中药资源与栽培驯化研究和中医药标准化研究,长期致力于以羌活为重点的特色资源植物的可持续利用、濒危资源植物的引种驯化和开发利用等方面的研究，主持承担国家自然基金、科技部、国家中医药局、国家发改委、国家环保部及四川省科技厅等各级（类）课题25项，被云南省院士专家工作站管委会批准建立了“蒋舜媛专家工作站”。发表学术论文70余篇，参编专著9部，国家发明专利3项，软件著作权1项，省级科技成果3项、二等奖2项，制定省级地方标准5项，培养博硕士研究生17名。