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RNA结合蛋白在基因转录后的剪接加工、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能。目前估计,人类基因组编码高达1500多种RNA结合蛋白,包括转录因子、DNA修复因子和转录调控复合物,这预示着RNA结合蛋白功能将超乎我们的想象,其新的功能就像月球背面隐藏的秘密,需要我们勇敢地去探索和发现。
GENCODE数据显示,>80%人类基因组存在转录的证据,其中3%的区域编码蛋白质,绝大部分转录区域可产生丰富的非编码RNA,包括参与转录调控的长非编码RNA(lncRNAs)和增强子RNA(eRNAs)。原则上,这些调控RNA(Regulatory RNAs)需要招募特异性的RNA结合蛋白来行使功能。最近,我们系统揭示了RNA结合蛋白是一类新的转录因子,可通过RNA依赖的染色质相互作用直接参与转录调控,也开辟了RNA结合蛋白功能研究的新领域。
大量的遗传学研究和全基因组关联研究(GWAS)揭示,大量的人类疾病与RNA结合蛋白的突变紧密关联。我们将运用前沿的ChIP-seq、GRO-seq、CLIP-seq、RNA-seq、Hi-C和GRID-seq等功能基因组学技术,系统地研究RNA结合蛋白的生物学功能和疾病发生机制。
RNA结合蛋白在基因转录后的剪接加工、修饰、转运、细胞定位、稳定性、翻译和降解等RNA代谢过程中发挥着重要的调控功能。目前估计,人类基因组编码高达1500多种RNA结合蛋白,包括转录因子、DNA修复因子和转录调控复合物,这预示着RNA结合蛋白功能将超乎我们的想象,其新的功能就像月球背面隐藏的秘密,需要我们勇敢地去探索和发现。
GENCODE数据显示,>80%人类基因组存在转录的证据,其中3%的区域编码蛋白质,绝大部分转录区域可产生丰富的非编码RNA,包括参与转录调控的长非编码RNA(lncRNAs)和增强子RNA(eRNAs)。原则上,这些调控RNA(Regulatory RNAs)需要招募特异性的RNA结合蛋白来行使功能。最近,我们系统揭示了RNA结合蛋白是一类新的转录因子,可通过RNA依赖的染色质相互作用直接参与转录调控,也开辟了RNA结合蛋白功能研究的新领域。
大量的遗传学研究和全基因组关联研究(GWAS)揭示,大量的人类疾病与RNA结合蛋白的突变紧密关联。我们将运用前沿的ChIP-seq、GRO-seq、CLIP-seq、RNA-seq、Hi-C和GRID-seq等功能基因组学技术,系统地研究RNA结合蛋白的生物学功能和疾病发生机制。
研究兴趣
论文共 45 篇作者统计合作学者相似作者
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Xian Du, Wenying Qin, Chunyu Yang, Lin Dai, Mingkui San, Yingdan Xia, Siyu Zhou, Mengyang Wang, Shuang Wu, Shaorui Zhang,Huiting Zhou, Fangshu Li,
Genome Biologyno. 1 (2024): 1-32
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