王鹏程教授主要从事蛋白组学和植物非生物胁迫信号转导研究，系统建立植物高精度磷酸化、SUMOylation、S-nitrosylation等蛋白组学方法，以技术创新驱动科学发现，发现并系统解析介导植物渗透胁迫感受和信号传递的RAF-SnRK2级联途径。在Nature Plants、Nature Communications、Molecular Cell、PNAS、Development Cell、Plant Cell等国际期刊发表研究论文70余篇，多篇文章被列为SCI高引研究论文并被国际同行在重要学术期刊Molecular Cell、Nature Communications、Trends in Plant Science等发表专评推荐。应邀在Annual Review in Plant Biology、Current Biology、Trends in Plant Science等国际重要期刊撰写评述文章。2021-2024年入选Stanford/Elsevier评选的顶尖科学家“Top 2% Scientists”、2024入选全球高被引学者（ Highly Cited Researcher 2024 by Clarivate）等。曾获得教育部/河南省自然科学一等奖、教育部“霍英东”青年教师奖等。