基本信息
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本实验室的研究主题包含生物学和质谱技术两部分,二者相辅相成,共同发展。
在生物学研究方面,我们以线虫为模式生物,试图了解衰老的生物学过程及其调控机制。在自然衰老过程中,线虫的转录组和蛋白质组将不可避免地发生一系列变化,借助高通量测序及质谱技术,我们可以对这些变化进行定量分析,并进一步探讨这些变化在长寿突变体线虫与野生型线虫之间有何不同。衰老过程在细胞器水平(如线粒体)上引起的变化也在我们的关注范围之内。对这些变化进行分析与归纳可以使我们更加深入地认识衰老过程,并为进一步研究调节衰老的机制打下坚实的基础。在衰老的调节机制的研究中,我们主要关注胰岛素信号通路。目前已经知道,从上游的胰岛素受体直至下游的FoxO转录因子,所有胰岛素信号通路的关键组分都具有调节寿命的功能。然而,FoxO转录因子可以在转录水平调节一系列靶蛋白,哪些关键靶蛋白最终导致了寿命的延长仍不清楚。我们希望找到这些关键靶蛋白,通过它们了解胰岛素信号通路调节寿命的奥秘。
在质谱方面,我们致力于基于质谱的蛋白质组学技术的应用与开发,以期为生物学研究提供新的思路与方法。目前,我们实验室日常的质谱分析工作包括蛋白鉴定、定量蛋白质组学分析以及翻译后修饰分析。样品多为免疫沉淀的蛋白复合物或全细胞裂解液。此外,我们与所内外其他研究者合作开发生物质谱技术,主要包括肽序列从头测序的算法开发、基于电子转移解离(ETD)谱图的高效蛋白质鉴定技术、和通过鉴定交联肽段来研究蛋白-蛋白相互作用的方法。实验室装备的质谱仪包括一台 Q Exactive和一台LTQ-Orbitrap-ETD。
在生物学研究方面,我们以线虫为模式生物,试图了解衰老的生物学过程及其调控机制。在自然衰老过程中,线虫的转录组和蛋白质组将不可避免地发生一系列变化,借助高通量测序及质谱技术,我们可以对这些变化进行定量分析,并进一步探讨这些变化在长寿突变体线虫与野生型线虫之间有何不同。衰老过程在细胞器水平(如线粒体)上引起的变化也在我们的关注范围之内。对这些变化进行分析与归纳可以使我们更加深入地认识衰老过程,并为进一步研究调节衰老的机制打下坚实的基础。在衰老的调节机制的研究中,我们主要关注胰岛素信号通路。目前已经知道,从上游的胰岛素受体直至下游的FoxO转录因子,所有胰岛素信号通路的关键组分都具有调节寿命的功能。然而,FoxO转录因子可以在转录水平调节一系列靶蛋白,哪些关键靶蛋白最终导致了寿命的延长仍不清楚。我们希望找到这些关键靶蛋白,通过它们了解胰岛素信号通路调节寿命的奥秘。
在质谱方面,我们致力于基于质谱的蛋白质组学技术的应用与开发,以期为生物学研究提供新的思路与方法。目前,我们实验室日常的质谱分析工作包括蛋白鉴定、定量蛋白质组学分析以及翻译后修饰分析。样品多为免疫沉淀的蛋白复合物或全细胞裂解液。此外,我们与所内外其他研究者合作开发生物质谱技术,主要包括肽序列从头测序的算法开发、基于电子转移解离(ETD)谱图的高效蛋白质鉴定技术、和通过鉴定交联肽段来研究蛋白-蛋白相互作用的方法。实验室装备的质谱仪包括一台 Q Exactive和一台LTQ-Orbitrap-ETD。
研究兴趣
论文共 225 篇作者统计合作学者相似作者
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时间
引用量
主题
期刊级别
合作者
合作机构
Journal of Lipid Researchpp.100553-100553, (2024)
Yuqiu Sun, Yu Cao,Huayun Wan, Adalet Memetimin,Yang Cao,Lin Li, Chongyang Wu, Meng Wang,She Chen,Qi Li,Yan Ma,Mengqiu Dong,
Zibin Zhou,Xiyuan Zheng, Jianxin Zhao, Aiyun Yuan, Zhuan Lv,Guangcan Shao, Bin Peng,Meng-Qiu Dong, Quan Xu, Xingzhi Xu,Jing Li
ONCOGENEpp.1-10, (2024)
Chen-Xi Zou, Zhu-Hui Ma,Zhao-Di Jiang,Zhao-Qian Pan,Dan-Dan Xu,Fang Suo,Guang-Can Shao,Meng-Qiu Dong,Li-Lin Du,Sharon A. Tooze, Richard Hodge, Richard Hodge,
PLoS biologyno. 11 (2023): e3002372-e3002372
PLOS BIOLOGYno. 12 (2023)
Cellno. 9 (2023): 1912-+
The Journal of biological chemistryno. 6 (2023): 104738-104738
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D-Core
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