张亮生教授团队主要从事植物基因组学及其基因资源挖掘、率先解析了蓝星睡莲、王莲、百合、嘉兰、洋桔梗、茉莉花、杜鹃花、满天星等花卉基因组，油菜和香蕉等经济作物基因组，聚焦花发育、抗性和品质等性状形成的基因资源挖掘，发现了一批花型花色和花香等品质性状形成相关的关键基因。自2020年以来，作为通讯作者在 Nature(2020，唯一通讯)、Nature Genetics（2024a, b，最后通讯和共同通讯）、Nature Communications（2025，最后通讯作者） 等国际知名期刊上发表了近 20 篇论文。入选全球前 2%顶尖科学家榜单，获福建省自然科学一等奖。