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Prospective de novo drug design with deep interactome learning
Kenneth Atz, Leandro Cotos,Clemens Isert, Maria Håkansson, Dorota Focht, Mattis Hilleke,David F Nippa, Michael Iff,Jann Ledergerber,Carl C G Schiebroek, Valentina Romeo,Jan A Hiss,
Nature communications（2024）
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G–PLIP: Knowledge graph neural network for structure-free protein–ligand bioactivity prediction
Simon J. Crouzet, Anja Maria Lieberherr,Kenneth Atz, Tobias Nilsson,Lisa Sach-Peltason,Alex T. Müller,Matteo Dal Peraro,Jitao David Zhang
Computational and Structural Biotechnology Journal (2024): 2872-2882
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Geometric deep learning-guided Suzuki reaction conditions assessment for applications in medicinal chemistry
Kenneth Atz, David F Nippa, Alex T Müller, Vera Jost, Andrea Anelli,Michael Reutlinger, Christian Kramer,Rainer E Martin, Uwe Grether,Gisbert Schneider,Georg Wuitschik
RSC medicinal chemistryno. 7 (2024): 2310-2321
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Leveraging molecular structure and bioactivity with chemical language models for de novo drug design
Michael Moret, Irene Pachon Angona, Leandro Cotos, Shen Yan,Kenneth Atz,Cyrill Brunner,Martin Baumgartner,Francesca Grisoni,Gisbert Schneider
Nature Communicationsno. 1 (2023): 114-114
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