基本信息
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Career Trajectory
Bio
癌症是由多种基因突变造成的恶性疾病。大规模癌症基因组研究使我们对癌症有了更加深入的认识,然而仍有一些关键问题亟待解决。一些基因型的肿瘤缺乏可用的治疗靶点,此外,许多靶点属于传统药物模式下的“不可成药”靶点。我们在以下几个方向开展研究,以拓展肿瘤精准治疗。
1)肿瘤中新治疗靶点的发现。一方面,我们通过对大规模肿瘤基因组数据库的深度分析,阐述肿瘤中基因突变的分布规律,从相对低频的突变中发现新型驱动突变;我们还构建高了精度的基因扩增-基因位置数据集,发现通过基因扩增驱动肿瘤的新靶点。另一方面,我们通过全基因组CRISPR筛选,对经典的癌症相关信号通路如Wnt、TGF、VHL-HIF等进行深度研究,发现这些通路的新的重要调控基因,其中的一些可能为某些基因型的肿瘤提供治疗靶点。
2)已有抗癌药物的合成致死基因的筛选。利用全基因组CRISPR筛选技术,我们对近40种抗癌药物进行了全面分析,发现了决定各类药物抗癌活性的最重要基因。相关结论可为各类抗癌药物的精准使用提供生物标志物,也可为这些药物提供合成致死靶点,从而改善药物的治疗效果。
3)针对已知的癌症驱动蛋白,以及上述研究中所发现的新型促癌蛋白和合成致死靶点,如果其属于“不可成药”靶点,我们将探索通过蛋白靶向降解的方式对这些靶点进行拮抗,以提供新的候选靶向药物。
此外,我们还将发展并应用更多类型的基因筛选体系和药物发现平台,为拓展疾病的精准治疗提供助力。
1)肿瘤中新治疗靶点的发现。一方面,我们通过对大规模肿瘤基因组数据库的深度分析,阐述肿瘤中基因突变的分布规律,从相对低频的突变中发现新型驱动突变;我们还构建高了精度的基因扩增-基因位置数据集,发现通过基因扩增驱动肿瘤的新靶点。另一方面,我们通过全基因组CRISPR筛选,对经典的癌症相关信号通路如Wnt、TGF、VHL-HIF等进行深度研究,发现这些通路的新的重要调控基因,其中的一些可能为某些基因型的肿瘤提供治疗靶点。
2)已有抗癌药物的合成致死基因的筛选。利用全基因组CRISPR筛选技术,我们对近40种抗癌药物进行了全面分析,发现了决定各类药物抗癌活性的最重要基因。相关结论可为各类抗癌药物的精准使用提供生物标志物,也可为这些药物提供合成致死靶点,从而改善药物的治疗效果。
3)针对已知的癌症驱动蛋白,以及上述研究中所发现的新型促癌蛋白和合成致死靶点,如果其属于“不可成药”靶点,我们将探索通过蛋白靶向降解的方式对这些靶点进行拮抗,以提供新的候选靶向药物。
此外,我们还将发展并应用更多类型的基因筛选体系和药物发现平台,为拓展疾病的精准治疗提供助力。
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Pengyu Fan, Xue-Ying Shang,Aixia Song,Shuo Chen, Run-Yuan Mao,Jiwei Chen,Zhenning Wang,Hai Zheng,Bolin Tao,Wei Xu,Wei Jiang,Huijuan Yang,
biorxiv(2024)
Protein & Cellno. 7 (2023): 534-539
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